biologia molekularna krótkie wykłady sekcja D

 0    127 informačný list    aleksanderwieckowski
stiahnuť mp3 vytlačiť hrať Skontrolujte sa
 
otázka język polski Odpoveď język polski
escherichia coli jaki ma genom
začať sa učiť
genom prokariotyczny
jak wygląda DNA E. coli
začať sa učiť
pojedyncza koliście zamknięta cząsteczka DNA
jaka długość ma DNA E. coli
začať sa učiť
4.6 miliona par zasad
W co jest upakowane DNA E. coli
začať sa učiť
w nukleoid
jakie stężenie ma nukleoid E. coli
začať sa učiť
(duże) 30-50 mg*ml-1
z ilu domen składa się nukleoid E. coli
začať sa učiť
50-100 domen
kształt nukleidu e. coli
začať sa učiť
domeny przytwierdzone do białka przytwierdzonego do błony komórkowej widok gwiazdy
Chromosom E. coli całościowo jest jaki?
začať sa učiť
Superhelikalny ∆Lk? Ln(n) =0.06
Co niepozwala rotować się DNA E. coli
začať sa učiť
Przyłaczenie DNA do białkowo-błonowego rusztowania
Najczęstsze białka wiążące DNA?
začať sa učiť
HU i H-NS
Białko HU jest?
začať sa učiť
-małe; zasadowe; z ładunkiem dodatnim; w postaci dimeru
jak białko HU wiąże DNA?
začať sa učiť
Wiąże owijając wokół własnej cząsteczki
Inna nazwa białka H-NS
začať sa učiť
wcześniejsza nazwa białko H1
Białko H-NS jest?
začať sa učiť
monomerem; ma obojętny ładunek;
Białko H-NS preferuje wiązanie się z DNA jakim?
začať sa učiť
Niespecyficznym przede wszystkim miejsca zagięć helisy DNA
Angielska nazwa H-NS oraz HU (zwyczajowa)
začať sa učiť
Białko podobne do histonów - Histone-like proteins
na co ma wpływ białka H-NS oraz HU
začať sa učiť
na kondensacje DNA
Do czego jest potrzebna kondensacja DNA
začať sa učiť
Jest niezbędna by upakować DNA w nukleotyd i utrzymaniu struktury superhelikalnej chromosomu
co znaczy ∆Lk/Lk(-3)
začať sa učiť
ze mamy jeden skręt superhelikalny na każde 17 skrętów helisy, w tym połowa skrętów jest wymuszona przez trwałe owiniecie wokół białek HU
inne ważne czynniki w organizowaniu domen DNA
začať sa učiť
białka, RNA, mRNA, polimeraza RNA
homolog białka HU?
začať sa učiť
białka IHF (integration host factor- integralny czynnik gospodarza)
Ile razy genom prokariota może być mniejszy od genomu eukariota
začať sa učiť
Tysiące
DNA eukariota jest upakowany między innymi?
začať sa učiť
w chromosomach
Ile chromosomów ma człowiek
začať sa učiť
46
jaką ma długość DNA w chromosomach
začať sa učiť
około kilku cm liniowej cząsteczki
jak wielkie jest jądro Eukariota
začať sa učiť
zbliżone do wielkości bakterii
Jak duże stężenie DNA może być
začať sa učiť
nawet 200 mg*ml(-1)
Co to chromatyna
začať sa učiť
to kompleks DNA i białek (kompleks nukleoproteinowy) tworzący stopień upakowania DNA
ile procent masy chromatyny to białko
začať sa učiť
50%
w jakiej fazie najbardziej jest skondensowany chromosom
začať sa učiť
w metafazie
w jakiej fazie chromosom jest mocno rozproszony
začať sa učiť
w interfazie
Co to histon
začať sa učiť
to białka wchodzące w skład chromatyny
na jakie klasy dzielimy histony?
začať sa učiť
H2A, H2B, H3 i H4 to histony rdzeniowe oraz H1
co to histony rdzeniowe
začať sa učiť
to histon klasy H2A, H2B, H3 i H4
jakie są histony rdzeniowe w porównaniu do H1
začať sa učiť
małe białka(mniejsze niż H1), mają masę od 10 do 20 kDa
histony są
začať sa učiť
mocno dodatnie ładunkiem (ułatwia to silne wiązania z ujemnym DNA), 20 do 30% to zasadowe aminokwasy lizyna oraz arganina
jaką masę mają histony H1
začať sa učiť
23 kDa
ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów
začať sa učiť
ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów
Nukeaza to?
začať sa učiť
Enzym hydrolizujący wiązanie fosfodiestrowe w kwasach nukleinowych
Egzonukleazy uwalniają?
začať sa učiť
pojedyńczę nukleotydy z końców nici kwasów nukleinowych
Endonukleazy rozcinają?
začať sa učiť
rozcinają wnętrza wiązań fosfodiestrowych
Co powoduje potraktowanie chromatyny nukleazą z mikrokoków?
začať sa učiť
Powoduje do izolacji fragmentu DNA o różnej wielkości będącą wielokrotnością około 200 pz.
200 pz jest z czym zasocjowane
začať sa učiť
jest zasocjowane histonowym rdzeniem (okręcone wokół rdzenia) z histonów H2a, H2B, H3 i H4 czyli histonów rdzeniowych
Po pierwszym wycięciu chromatyny nukleazą z mikrokoków i pozostawieniu w dalszym trawieniu nukleazą co się stanie
začať sa učiť
zostanie struktura zawierająca fragment 146 pz która jest silnie zasocjowana z histonowym oktamerem (histonami rdzeniowymi) wykazuje ona podobieństwo strukturalne niezależnie od miejsca z którego została wycięta
na histonowym rdzeniu oktamerowym mamy ile pz
začať sa učiť
mamy 146 pz owijające się 1.8 lewoskrętnego zwoju tworząc superhelikalność
Co to nukleosom
začať sa učiť
nukleosom to rdzeń histonowy (oktamerowy) z nawiniętym DNA w 1.8 skrętu czyli z 146 pz
H1 gdzie się przyczepia?
začať sa učiť
Przyczepia się do nukleosomu stabilizując miejsce wejścia oraz wyjścia DNA nawijając 20 pz co daje ładnie 166 pz
Czemu odpowiada 166 pz nawiniętych na rdzeń nukleosomu oraz na histon H1
začať sa učiť
odpowiada 2 pełnym skrętom
Czemu H1 jest większe?
začať sa učiť
bo ma dodatkowy ogon "C-końcowy" który odpowiada za stabilność DNA pomiędzy nukleosomami
Czy histon H1 może być zamieniony na inny?
začať sa učiť
W niektórych typach komórek może być zamieniony na swój skrajny wariant na histon H5 który nie ulega transkrypcji.
Co to sznur koralików?
začať sa učiť
to nukleosony wraz z DNA łacznikowym które jest cienką nicią DNA która uzupełnia do 200 pz powtarzających się podczas doświadczenia z nukleazą
ule wynosi standardowo DNA łącznikowe?
začať sa učiť
Zwykle około 55pz ale może mieć od kilku do nawet 100 pz
czy histon H1 zwiększa organizacje "koralików"?
začať sa učiť
Tak wraz z wzrostem stężenia soli aż do powstania włókien średnicy 30nm
Jak nazywa się lewostronna zawinięta helisa wyższego rzędu?
začať sa učiť
jest to solenoid
na jeden obrót w solenoidzie przypada ile nukleosomów?
začať sa učiť
6 nukleosomów
Długość DNA w pętli eukariota to?
začať sa učiť
100 pz w przybliżeniu tyle co u prokariota jednak w chromosomie eukariotycznym mamy znacznie więcej pętli
przez co są końce pętli unieruchomione?
začať sa učiť
są unieruchomione przez rusztowanie białkowe lub matriks jądrowy (czyli kompleksy białkowe)
Jak wyglądają wymiary wyższych struktur uporządkowania DNA?
začať sa učiť
tworzą się włókna o średnicy 30 nm oraz z nich pętle o szerokości 300nm
w jakiej fazie chromosom jest najbardziej skondensowany?
začať sa učiť
w mitozie
przed czym chroni chromosom duże skondensowanie?
začať sa učiť
Przed rozerwaniem DNA
Przez co są rozdzielane chromosomy?
začať sa učiť
Przez wrzeciono mitotyczne.
Co mamy na końcach chromosomów oraz DNA
začať sa učiť
Telomery
Centromer to
začať sa učiť
Ograniczony rejon gdzie łącza się dwie chromatydy siostrzane tworząc chromosom
co to kinetochor
začať sa učiť
kompleks białkowy przyłączający się do mikrotubul wrzeciona mitotycznego
Co rozdzielają mikrotubule
začať sa učiť
Rozdzielają chromatydy podczas anafazy
długość centromeru u drożdży?
začať sa učiť
88pz bogatych w AT
Centromer Eukariota ograniczony jest
začať sa učiť
satelitarnym DNA (sekwencjami powtarzającymi się)
Co zawiera telomer?
začať sa učiť
zawiera setki kopi sekfencji (5-TTAGGG-3 u człowieka)
Co syntetyzuje telomeraza
začať sa učiť
sekfencje (5-TTAGGG-3)
co to telomeraza?
začať sa učiť
jest to rodzaj rybonukleoproteiny
Co zabezpiecza telomer
začať sa učiť
końcówkę chromosomu
Jak uchronić telomer przed skracaniem?
začať sa učiť
należy syntetyzować niezależnie telomer
co zachodzi podczas interfazy
začať sa učiť
transkrypcja genów na chromosomach oraz replikacja DNA
jak długo trwa faza S (interfaza)
začať sa učiť
większość czasu
jaką strukturę przyjmują chromosomy podczas interfazy?
začať sa učiť
przyjmują strukturę bardziej rozproszoną nie da się ich rozróżnić
co to heterohromatyna
začať sa učiť
jest to część chromatyny w interfazie jaka dalej jest mocno skondensowana jednak nie aż tak silnie jak w metafazie
z czego składa się heterochromatyna
začať sa učiť
z satelitarnego DNA jest transkrypcyjnie nieaktywna przykładem jest chromosom X u samic ssaków.
gdzie widzimy heterochromatynę w jądrze pod mikroskopem
začať sa učiť
widzimy ją na obrzeżach jądra jako ciemne prążki
Co to Euchromatyna
začať sa učiť
pozostała część chromatyny inna niż heterochromatyna
Co się dzieje z Euchromatyną aktywną transkrypcyjnie
začať sa učiť
może być bardziej rozproszona już rozwinięta z pętli 30nm aż do sznura koralików czy nawet odwinięta z nukleosomów by łatwo przyłączać czynniki transkrypcyjne
Jaka cześć euchromatyny jest aktywna transkrypcyjnie?
začať sa učiť
10%
gdzie znajduje się gen?
začať sa učiť
w miejscach aktywnych transkrypcyjnie
jak mapuje się miejsca aktywne transkrypcyjnie?
začať sa učiť
szuka się miejsc z nadwrazliwościa na DNazę I czyli deoksyrybonukleazę I
Co robi DNaza I
začať sa učiť
rozcina DNA
sygnał do odpowiedniego poziomu upakowania chromosomu w miejscach genów ulegających ekspresji jest?
začať sa učiť
metylacja C-5 cytozyny występująca w sekfencji 5-CG-3
powszechnie nazwa metylacji C - 5 cytozyny?
začať sa učiť
metylacja CpG
gdzie znajdują się niezmetylowane wyspy CpG?
začať sa učiť
W obrębie genów aktywnych transkrypcyjnie
Jak długie są niezmetylowane wyspy CpG?
začať sa učiť
2000 pz
co się dzieje z zmetylowaną sekwencją CpG?
začať sa učiť
szybko mutuje do TpG z powodu spontanicznej deaminacji 5'-metylocytozyny do tyminy
przykład występowania histonu H5?
začať sa učiť
w krwinkach czerwonych ptaków
aktywnej transkrypcji chromatyny towazyszy
začať sa učiť
acetylacja reszty lizyny w N-końcowych domenach
co towarzyszy kondensacji chromosomów?
začať sa učiť
fosforylacja histonu H1
unikatowe sekwencje DNA
začať sa učiť
hybrydyzują wolniej, są często aktywne transkrypcyjnie
tandemowe zespoły genów
začať sa učiť
to takie jakie maja sekwencje transkrypcyjną wielokrotnie powtórzona. np geny transkrybujące RNA czy DNA
sekwencje SINES
začať sa učiť
krótkie elementy rozproszone od kilkuset pz
sekwencje LINES
začať sa učiť
od tysiąca do 5 tysięcy pz (długie elementy rozproszone
najpopularniejsze LINES u człowieka
začať sa učiť
sekfencja Alu
długość sekwencji Alu?
začať sa učiť
300pz
jak często występuje Alu?
začať sa učiť
300000 a 500000 razy się powtarza z 80% 90% procentową powtarzalnością
długość DNA satelitarnego?
začať sa učiť
od 2 do 20-30 pz
podział DNA sateliarnego?
začať sa učiť
minisatelity oraz mikrosatelity
minisatelity
začať sa učiť
tandemowe powtórzenia o zmiennej liczbie powtórzeń VNTR
mikrosatelity
začať sa učiť
proste powtórzenia tandemowe STR
gdzie znajdziemy minisatelity VNRT
začať sa učiť
najczęściej w pobliżu końca chromosomów
Gdzie znajdziemy mikrosatelity? (SRT)
začať sa učiť
wzdłuż całego chromosomu
do czego stosujemy minisatelity
začať sa učiť
do zbadania odcisku DNA np w celu sprawdzeniu pokrewieństwa
sekwencja polimorficzna
začať sa učiť
to sekwencja inna niż na chromosomie homologicznym lub jeśli występuje inna sekwencja niż standardowa u danego gatunku
SNP
začať sa učiť
polimorfizm pojedynczych nukleotydów
SSLP
začať sa učiť
polimorfizm długości pojedynczej sekwencji
RFLP
začať sa učiť
polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych
dogmat biologii molekularnej
začať sa učiť
Z DNA powstaje RNA które tworzy białka
polimeraza RNA co robi
začať sa učiť
transkrybuje gen poczynając od promotora a kończąc na terminatorowej sekwencji
RNA kodujący kilka białek to
začať sa učiť
RNA polistronicowy
translacja RNA na białko odbywa się w?
začať sa učiť
rybosomach
miejsce RNA gdzie koduje kilka białek nazywane jest?
začať sa učiť
Operonem
RNA jakie jest tłumaczone w Rybosomach to
začať sa učiť
mRNA (messege RNA)
kodon startu to
začať sa učiť
kodon inicjatorowy zwykle AUG
tRNA mają funkcje?
začať sa učiť
transportują aminokwasy do rybosomów w celu tworzenia białek (tRNA - transport RNA)
jak wygląda ekspresja genów u prokariota
začať sa učiť
polimeraza RNA transkrybuje gen następnie przez transkrypcje mRNA i przenoszony do rybosomu tam udział tRNA które donosi aminokwasy. Zwykle sekfencja kodonu inicjatora to AUG przy końcu 5' a terminator jest na końcu 3'
pre-mRNA
začať sa učiť
RNA jakie jest transkrybowane w jądrze komórkowym i syntetyzowane przez polimeraze II
pre - mRNA jest transkrybowane przez którą po
začať sa učiť
polimeraze II
zwykle u eukariota jest kodowane tylko jedno białko
začať sa učiť
miejsca transkrypcyjne są monostronicowe
kapowanie
začať sa učiť
czyli dodanie do pre-mRNA ogonu poli (A) na końcu 3' co zwiększa stabilność
introny
začať sa učiť
sekwencję przerywające kodowanie białka
splicing
začať sa učiť
usuwanie intronów z pre-mRNA i powstanie eksonów
snRNA
začať sa učiť
małe jąderkowe RNA
snRNA powstaje?
začať sa učiť
w wyniku splicingu

Ak chcete pridať komentár, musíte byť prihlásený.